15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4001 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4001  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  746    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000201324  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  31.38 
 
 		 608 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  22.05 
 
 		 609 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  30.32 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  28.04 
 
 		 685 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  28.04 
 
 		 685 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  26.79 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  30.17 
 
 		 560 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 814 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  30.63 
 
 		 688 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  32.17 
 
 		 636 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  24.65 
 
 		 605 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 576 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  32.11 
 
 		 564 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>