More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3667 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3465  transposase mutator type  96.5 
 
 
425 aa  831    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000204255  normal  0.0284562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3667  transposase mutator type  100 
 
 
427 aa  875    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491111  normal  0.134883 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4522  transposase, mutator type  79.77 
 
 
430 aa  721    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0698256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10938  transposase  71.15 
 
 
439 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4284  transposase mutator type  66.75 
 
 
428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4287  transposase mutator type  66.12 
 
 
428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0323  transposase mutator type  66.12 
 
 
428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4268  transposase mutator type  66.12 
 
 
428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2471  transposase mutator type  66.12 
 
 
428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1651  transposase mutator type  54.03 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0586  transposase, mutator type  55.83 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  50.36 
 
 
424 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  61.28 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  47.37 
 
 
459 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  47.13 
 
 
462 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  47.13 
 
 
462 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  47.13 
 
 
462 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  47.13 
 
 
459 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  47.13 
 
 
462 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  47.13 
 
 
462 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  46.29 
 
 
404 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  46.29 
 
 
404 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  46.29 
 
 
404 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  46.29 
 
 
404 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  46.29 
 
 
404 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  46.29 
 
 
404 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  46.29 
 
 
404 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  46.29 
 
 
404 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  45.52 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  45.52 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  45.52 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  45.1 
 
 
408 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  45.1 
 
 
408 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  45.5 
 
 
408 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  45.5 
 
 
408 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  44.85 
 
 
408 aa  353  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  44.85 
 
 
408 aa  353  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  44.02 
 
 
403 aa  352  5e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  44.85 
 
 
408 aa  353  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  45.34 
 
 
451 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  45.34 
 
 
451 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  44.85 
 
 
408 aa  352  8e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  44.85 
 
 
408 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  46.59 
 
 
393 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  44.79 
 
 
425 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  44.79 
 
 
425 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  44.79 
 
 
425 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  44.53 
 
 
425 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  47 
 
 
407 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  44.53 
 
 
425 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  43.09 
 
 
426 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  43.09 
 
 
426 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  43.09 
 
 
426 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  45.24 
 
 
406 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  44.77 
 
 
462 aa  343  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  44.77 
 
 
462 aa  343  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  44.77 
 
 
462 aa  343  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  44.77 
 
 
462 aa  343  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  46.97 
 
 
447 aa  342  7e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  46.97 
 
 
447 aa  342  8e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  46.94 
 
 
411 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  46.7 
 
 
447 aa  342  9e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  46.7 
 
 
447 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  46.7 
 
 
447 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  44.53 
 
 
462 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  45.3 
 
 
416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  43.61 
 
 
416 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  45.11 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  45.11 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  43.49 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  44.47 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  41.59 
 
 
455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  44.47 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  44.47 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  41.59 
 
 
455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  41.59 
 
 
455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  44.47 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  44.47 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  44.47 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  46.21 
 
 
407 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  46.21 
 
 
407 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  43.61 
 
 
416 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  43.61 
 
 
416 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  46.83 
 
 
449 aa  335  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  46.83 
 
 
449 aa  335  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  42.22 
 
 
402 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  46.83 
 
 
449 aa  335  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  44.06 
 
 
422 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  46.83 
 
 
449 aa  335  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  45 
 
 
415 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  43.81 
 
 
422 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  45.74 
 
 
406 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  43.81 
 
 
422 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  43.13 
 
 
415 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  43.81 
 
 
422 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  46.56 
 
 
449 aa  332  8e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  39.62 
 
 
411 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  43.08 
 
 
402 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  43.08 
 
 
402 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  43.08 
 
 
402 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>