18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3106 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1020    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000141938  hitchhiker  0.000284669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1322  hypothetical protein  32.16 
 
 		 539 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.322613  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2750  putative integral membrane transport protein  32.04 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2591  hypothetical protein  30.19 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36100  hypothetical protein  28.14 
 
 		 528 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0679941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0944  hypothetical protein  29.66 
 
 		 532 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4501  hypothetical protein  27.49 
 
 		 560 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.263243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26400  hypothetical protein  28.47 
 
 		 575 aa  78.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2865  hypothetical protein  27.18 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0216967  normal  0.115817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0975  hypothetical protein  30.27 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16467  hitchhiker  0.00124053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23120  hypothetical protein  25.13 
 
 		 570 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07180  hypothetical protein  28.17 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.685735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2323  hypothetical protein  26.65 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000190454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5013  hypothetical protein  25.98 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3073  ABC transporter permease protein  26.29 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00508741  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1136  hypothetical protein  23.17 
 
 		 550 aa  63.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1844  hypothetical protein  26.19 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2590  hypothetical protein  27.64 
 
 		 618 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>