49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1756 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  100 
 
 		 551 aa  1056    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  58.61 
 
 		 551 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  36.98 
 
 		 531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  37.28 
 
 		 550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  31.92 
 
 		 555 aa  240  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  34.5 
 
 		 566 aa  239  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  36.82 
 
 		 548 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  35.41 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.33 
 
 		 529 aa  220  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  29 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.83 
 
 		 652 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  33.27 
 
 		 552 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  33.66 
 
 		 552 aa  204  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  31.88 
 
 		 565 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  36.13 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  33.98 
 
 		 545 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  34.63 
 
 		 540 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  33.21 
 
 		 523 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  34.14 
 
 		 532 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  35.24 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.46 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.46 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.46 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  33.46 
 
 		 532 aa  177  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.67 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  34.64 
 
 		 529 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  30.87 
 
 		 541 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.73 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  29.89 
 
 		 530 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  33.27 
 
 		 528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  32.18 
 
 		 549 aa  157  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30.35 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.53 
 
 		 533 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  32.75 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  31.15 
 
 		 540 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  29.65 
 
 		 555 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  28.03 
 
 		 500 aa  139  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  31.75 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  25.14 
 
 		 536 aa  130  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  30.63 
 
 		 496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  26.93 
 
 		 542 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.9 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.9 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  28.04 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.75 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  28.96 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.05 
 
 		 265 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  37.4 
 
 		 143 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  38.68 
 
 		 270 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>