More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0924 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0924  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
421 aa  855    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1006  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.04 
 
 
421 aa  351  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.283424  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0029  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.74 
 
 
423 aa  346  6e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.07 
 
 
427 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0813  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 
421 aa  343  4e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.136066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.01 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.04 
 
 
427 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.73 
 
 
427 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.73 
 
 
427 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 
426 aa  332  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.34 
 
 
429 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.46 
 
 
442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.98 
 
 
424 aa  328  9e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.46 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.36 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.46 
 
 
420 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.95 
 
 
420 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.37 
 
 
449 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.31 
 
 
426 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.95 
 
 
420 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.01 
 
 
422 aa  315  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.95 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.12 
 
 
426 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.18 
 
 
704 aa  310  4e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.53 
 
 
436 aa  310  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.38 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.15 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.02 
 
 
426 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 
420 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.49 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.23 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.63 
 
 
433 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.72 
 
 
435 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 
419 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
424 aa  302  9e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.11 
 
 
425 aa  301  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.48 
 
 
435 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.09 
 
 
423 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.89 
 
 
420 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.32 
 
 
428 aa  300  5e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.1 
 
 
429 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.1 
 
 
429 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.52 
 
 
430 aa  299  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.09 
 
 
423 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.42 
 
 
425 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.67 
 
 
437 aa  297  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 
429 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.19 
 
 
428 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.62 
 
 
429 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.8 
 
 
424 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.14 
 
 
430 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.94 
 
 
428 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.98 
 
 
420 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.19 
 
 
427 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2728  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 
420 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0882976  normal  0.135316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
430 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.98 
 
 
425 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.06 
 
 
419 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.38 
 
 
429 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 
429 aa  292  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.89 
 
 
419 aa  292  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 
429 aa  292  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.8 
 
 
430 aa  292  9e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.76 
 
 
429 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.76 
 
 
423 aa  292  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  38.48 
 
 
429 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.48 
 
 
429 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  38.48 
 
 
429 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.05 
 
 
424 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  38 
 
 
432 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 
429 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.66 
 
 
428 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.66 
 
 
428 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.86 
 
 
429 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.89 
 
 
429 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  38.85 
 
 
430 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.1 
 
 
428 aa  290  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.66 
 
 
428 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.7 
 
 
428 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.21 
 
 
427 aa  289  6e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.05 
 
 
424 aa  289  6e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.59 
 
 
437 aa  289  6e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
423 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.32 
 
 
423 aa  289  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
423 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.68 
 
 
446 aa  289  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.66 
 
 
428 aa  288  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.03 
 
 
432 aa  288  9e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
429 aa  288  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.52 
 
 
430 aa  288  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1523  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.62 
 
 
424 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.89 
 
 
427 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
423 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.2 
 
 
423 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.26 
 
 
428 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.4 
 
 
423 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.55 
 
 
429 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.15 
 
 
423 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>