More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0029 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0029  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
423 aa  855    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1006  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.97 
 
 
421 aa  504  1e-141  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.283424  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0813  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.68 
 
 
421 aa  498  1e-140  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.136066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 
424 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
429 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.62 
 
 
449 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 
427 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 
426 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 
427 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 
427 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 
427 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
427 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 
442 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
426 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 
425 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 
427 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 
426 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 
427 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
433 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.32 
 
 
433 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 
420 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 
422 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
426 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
429 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
422 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
428 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 
427 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.56 
 
 
435 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
431 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.33 
 
 
435 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
423 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 
428 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
424 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.66 
 
 
422 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.02 
 
 
427 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 
420 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.37 
 
 
456 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.59 
 
 
429 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 
429 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
420 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 
429 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 
429 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
428 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
428 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.09 
 
 
430 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
423 aa  362  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 
429 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 
423 aa  362  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.04 
 
 
432 aa  362  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 
429 aa  362  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 
429 aa  362  9e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
428 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  42.35 
 
 
429 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  42.35 
 
 
429 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.52 
 
 
423 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.44 
 
 
423 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 
423 aa  359  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 
429 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 
425 aa  358  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 
430 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 
424 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39441  predicted protein  47.52 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.178853  normal  0.0538587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.23 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0924  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.74 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.72 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.72 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 
431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
429 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
429 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
425 aa  355  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 
423 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.28 
 
 
428 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
430 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.32 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.12 
 
 
429 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 
429 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.41 
 
 
429 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.61 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 
423 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.8 
 
 
425 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 
423 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 
423 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1013  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
421 aa  353  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0926645  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 
423 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 
429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.61 
 
 
423 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.23 
 
 
419 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
429 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  40.47 
 
 
430 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>