32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03911 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  100 
 
 
161 aa  320  6e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  96.27 
 
 
177 aa  309  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  47.13 
 
 
178 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  43.03 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  41.88 
 
 
164 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  39.75 
 
 
178 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  37.11 
 
 
173 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  32.72 
 
 
179 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  36.25 
 
 
177 aa  97.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  37.74 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  38.36 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  32.69 
 
 
191 aa  91.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  37.11 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  32.69 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  31.41 
 
 
188 aa  87.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  37.11 
 
 
182 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  26.92 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  29.38 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  27.22 
 
 
197 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  24.36 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  29.3 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  28.79 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  31.85 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  26.42 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  26.42 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  26.52 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  27.85 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  26.38 
 
 
197 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  27.85 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  24.54 
 
 
198 aa  54.7  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  24.22 
 
 
174 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>