53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1922 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  83.39 
 
 
271 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  58.31 
 
 
345 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4438  hypothetical protein  94.05 
 
 
84 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  30.09 
 
 
405 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  27.05 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  27.94 
 
 
418 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  26.27 
 
 
402 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  27.94 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  27.94 
 
 
418 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  26.98 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  26.98 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  26.98 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  26.98 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  26.98 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  26.98 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  26.98 
 
 
418 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  26.67 
 
 
418 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  26.98 
 
 
418 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 
418 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  26.98 
 
 
418 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  26.18 
 
 
418 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  29.66 
 
 
408 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  26.22 
 
 
389 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  27.18 
 
 
398 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  27.18 
 
 
398 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  29.11 
 
 
404 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  26.8 
 
 
378 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  27.74 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  27.08 
 
 
658 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  26.21 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  25.16 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  26.63 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  26.17 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  28.97 
 
 
211 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  28.97 
 
 
224 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  28.97 
 
 
211 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  28.97 
 
 
211 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  28.97 
 
 
211 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  28.97 
 
 
211 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1617  cupin domain-containing protein  28.97 
 
 
211 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1819  hypothetical protein  28.08 
 
 
211 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2487  hypothetical protein  25.95 
 
 
210 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00410719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2547  hypothetical protein  25.95 
 
 
210 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2202  hypothetical protein  26.32 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2408  hypothetical protein  29 
 
 
210 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2923  hypothetical protein  25.19 
 
 
210 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.112138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2259  cupin domain-containing protein  25.95 
 
 
210 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2468  hypothetical protein  25.19 
 
 
174 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2245  hypothetical protein  30.38 
 
 
210 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0710314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  30.61 
 
 
182 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  28.57 
 
 
182 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  31.82 
 
 
150 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>