22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0388 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  63.11 
 
 		 138 aa  174  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  52.85 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  52.38 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  51.22 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  52.59 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  47.58 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  49.18 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  44.63 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  43.97 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  46.43 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  42.15 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  41.13 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  40.8 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  40.65 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  46.36 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  41.74 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  36.29 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  32.52 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  35.34 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  31.48 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>