63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3298 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3298  protein of unknown function DUF423  100 
 
 		 131 aa  240  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00419882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3362  hypothetical protein  50.86 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.389012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3501  hypothetical protein  53.4 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2628  protein of unknown function DUF423  51.02 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.382663  normal  0.0718783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5379  protein of unknown function DUF423  52.75 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2349  hypothetical protein  51.02 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7328  hypothetical protein  45.69 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2649  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5083  hypothetical protein  57.97 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225516  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3072  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628352  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0815  hypothetical protein  43.44 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2306  protein of unknown function DUF423  50 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.454103  normal  0.0930723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1480  hypothetical protein  44.32 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0634  hypothetical protein  55.81 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0629  hypothetical protein  36.75 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3445  hypothetical protein  39.13 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104865  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3701  hypothetical protein  40.87 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  34.15 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  34.15 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  31.03 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0071  hypothetical protein  38.78 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00440778 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3063  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.47901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4071  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2948  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000825789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0905  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02619  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3177  hypothetical protein  36.11 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0881  protein of unknown function DUF423  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3113  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2951  hypothetical protein  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.01255e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02658  conserved inner membrane protein  34.65 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  35.25 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  25.62 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3306  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0654782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3126  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000001734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3143  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00090815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3191  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0186134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3206  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0634  protein of unknown function DUF423  41.76 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0359  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3253  hypothetical protein  31.71 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.222088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0230  hypothetical protein  29.41 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1903  protein of unknown function DUF423  35.51 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  27.42 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0681  hypothetical protein  55.56 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  35.34 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  32.11 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  35.34 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6267  protein of unknown function DUF423  31.71 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015945  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2662  hypothetical protein  30.84 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  31.67 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2331  hypothetical protein  44 
 
 		 122 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  30.58 
 
 		 128 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0152  hypothetical protein  29.84 
 
 		 127 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0331  protein of unknown function DUF423  29.84 
 
 		 125 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.120447 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0620  hypothetical protein  26.47 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0606  hypothetical protein  26.47 
 
 		 122 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  31.3 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0890  protein of unknown function DUF423  39.22 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  33.91 
 
 		 126 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>