40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2053 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  68.61 
 
 		 502 aa  669    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  76.29 
 
 		 508 aa  725    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  69.6 
 
 		 534 aa  711    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  77.02 
 
 		 509 aa  712    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  77.76 
 
 		 512 aa  747    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  76.12 
 
 		 516 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  69.44 
 
 		 500 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  68.41 
 
 		 502 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  76.83 
 
 		 508 aa  726    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  76.58 
 
 		 528 aa  772    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  77.55 
 
 		 540 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  77.55 
 
 		 535 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  69.35 
 
 		 521 aa  693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  76.24 
 
 		 533 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  76.5 
 
 		 468 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 513 aa  1037    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  78.04 
 
 		 508 aa  726    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  71.08 
 
 		 455 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  37.44 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  35.68 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  34.95 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  35.42 
 
 		 412 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  33.98 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  36.71 
 
 		 422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  37.8 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  33.1 
 
 		 422 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  34.61 
 
 		 418 aa  249  8e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  33.09 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.19 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.4 
 
 		 424 aa  47  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.18 
 
 		 468 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1873  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.34 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.56 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  28.5 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  28.5 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05981  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.34 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.926498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.34 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.4 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.21 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.2 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>