More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1694 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  71.21 
 
 
794 aa  1143    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  51.68 
 
 
764 aa  764    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  56.74 
 
 
809 aa  868    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  57.54 
 
 
810 aa  885    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  45.12 
 
 
758 aa  638    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  44.28 
 
 
812 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
779 aa  1580    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  45.1 
 
 
809 aa  674    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  54.38 
 
 
782 aa  836    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  56.35 
 
 
812 aa  873    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  43.54 
 
 
805 aa  644    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  57.97 
 
 
824 aa  882    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  57.6 
 
 
809 aa  904    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  55.25 
 
 
781 aa  826    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  42.81 
 
 
821 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  44.49 
 
 
758 aa  631  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  42.67 
 
 
819 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  44.14 
 
 
798 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  45.88 
 
 
806 aa  626  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  45.12 
 
 
803 aa  624  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  44.23 
 
 
758 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  43.91 
 
 
814 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  43.9 
 
 
805 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  44.29 
 
 
803 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  44.17 
 
 
794 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  43.61 
 
 
837 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1433  phosphoenolpyruvate synthase  44 
 
 
806 aa  620  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  42.61 
 
 
832 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  45.44 
 
 
760 aa  613  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  42.45 
 
 
794 aa  609  1e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  44.25 
 
 
815 aa  610  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  44.25 
 
 
799 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  44.25 
 
 
799 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  41.4 
 
 
839 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  41.4 
 
 
839 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  42.55 
 
 
838 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  42.45 
 
 
794 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  43.21 
 
 
803 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  43.34 
 
 
800 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  42.59 
 
 
790 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  41.55 
 
 
825 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  42.14 
 
 
793 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  43.34 
 
 
790 aa  599  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  42.65 
 
 
806 aa  600  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  42.98 
 
 
804 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  42.84 
 
 
795 aa  599  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  42.95 
 
 
803 aa  602  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  43.03 
 
 
805 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  42.65 
 
 
812 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  42.71 
 
 
791 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  43.88 
 
 
799 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  42.75 
 
 
791 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  43.07 
 
 
790 aa  598  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  42.5 
 
 
791 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  42.5 
 
 
791 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  42.63 
 
 
791 aa  595  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  42.47 
 
 
804 aa  593  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  42.26 
 
 
791 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  42.79 
 
 
801 aa  593  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  42.31 
 
 
792 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  42.68 
 
 
790 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 
798 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 
798 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  43.73 
 
 
765 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 
791 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 
798 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  42.36 
 
 
803 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  42.19 
 
 
791 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  42.2 
 
 
791 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  41.63 
 
 
801 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  42.07 
 
 
815 aa  585  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  41.92 
 
 
793 aa  588  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  43.18 
 
 
812 aa  588  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  42.36 
 
 
803 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  42.14 
 
 
795 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  41.39 
 
 
800 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  43.46 
 
 
795 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 
798 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  42.7 
 
 
778 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  41.51 
 
 
800 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  42.89 
 
 
789 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  42.89 
 
 
789 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  42.31 
 
 
810 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  42.24 
 
 
779 aa  582  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  41.26 
 
 
796 aa  582  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  41.47 
 
 
799 aa  582  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 
799 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  43.16 
 
 
790 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  41.51 
 
 
800 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2594  phosphoenolpyruvate synthase  40.94 
 
 
812 aa  579  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 
799 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 
799 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  41.51 
 
 
800 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  42.89 
 
 
789 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  41.32 
 
 
821 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  40.9 
 
 
789 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  41.61 
 
 
825 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  41.86 
 
 
800 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  43.78 
 
 
754 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  41.85 
 
 
801 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>