54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2308 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  46.78 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  30.41 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  30.77 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  34.16 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  31.58 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  31.58 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  30.26 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  32.64 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  29.87 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  29.53 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  26.57 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  31.69 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  32.39 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  28.67 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  31.69 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  36.6 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  26.54 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  31.72 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  30.28 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  30.34 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  30.34 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  27.7 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  31.72 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  24.85 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  24.85 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  28.39 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  28.29 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  24.24 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  26.53 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  26.53 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  26.67 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  26.35 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  26.53 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  27.88 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  31.54 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  28.83 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  25.56 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1692  hypothetical protein  26.35 
 
 		 138 aa  51.2  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 300 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 300 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 300 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 300 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 300 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 300 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  23.78 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  23.28 
 
 		 300 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  23.45 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  25.19 
 
 		 160 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  25.17 
 
 		 129 aa  40.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>