55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6192 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  100 
 
 
154 aa  299  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  76.87 
 
 
153 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  74.15 
 
 
154 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  73.1 
 
 
152 aa  206  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  55.26 
 
 
181 aa  160  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  46.15 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  46.15 
 
 
146 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4445  urease accessory protein UreE  47.22 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  35.14 
 
 
211 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  42 
 
 
213 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  30.6 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  42.42 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  42 
 
 
207 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  42 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  42.42 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  42.42 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  43.3 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  42 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  32.71 
 
 
208 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  32.71 
 
 
214 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  27.78 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  39.45 
 
 
227 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  38.53 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  40.4 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  31.34 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  38.83 
 
 
207 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1304  UreE urease accessory domain-containing protein  32.23 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1466  UreE urease accessory domain protein  32.23 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  26.17 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  39 
 
 
202 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  40 
 
 
228 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  38.61 
 
 
202 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  38.61 
 
 
210 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  30.28 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  27.1 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  27.1 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  38.61 
 
 
204 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  32.43 
 
 
173 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  39 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  26.5 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  31.2 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  28.28 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  34 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  32.04 
 
 
221 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  28.85 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  25.64 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1315  urease accessory protein UreE  29.85 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  24.09 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  23.13 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  30.77 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  35.42 
 
 
186 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  32.65 
 
 
216 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1359  urease accessory protein UreE  29.1 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  25 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0957  urease accessory protein UreE  27.1 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>