31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5760 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5760  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302544  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  77.61 
 
 
145 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3156  hypothetical protein  75.37 
 
 
145 aa  147  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3480  hypothetical protein  75.37 
 
 
145 aa  147  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3095  hypothetical protein  65.28 
 
 
145 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.137037 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  39.31 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  39.31 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  35.14 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  36.09 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  34.51 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  30.57 
 
 
309 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  34.59 
 
 
166 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  35.42 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  38.03 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  32.43 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  33.56 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  29.91 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  38.95 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  49.15 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  39.8 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  34.95 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  36.96 
 
 
263 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  31.94 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  44.16 
 
 
243 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  28.75 
 
 
469 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0932  hypothetical protein  36.08 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0749  hypothetical protein  32.5 
 
 
135 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.110319  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  36.22 
 
 
271 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  33.94 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>