More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3750 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  58.44 
 
 
691 aa  777    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  64.25 
 
 
680 aa  883    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  73.86 
 
 
679 aa  957    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  58.74 
 
 
686 aa  789    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.59 
 
 
682 aa  810    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  64.54 
 
 
738 aa  896    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  56.39 
 
 
682 aa  760    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  52.88 
 
 
714 aa  688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  63.48 
 
 
686 aa  813    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  65.59 
 
 
684 aa  890    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  59.38 
 
 
692 aa  794    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  68.59 
 
 
679 aa  932    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  64.31 
 
 
680 aa  893    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  59.94 
 
 
687 aa  790    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  52.94 
 
 
802 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  68.54 
 
 
678 aa  921    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  54.64 
 
 
678 aa  709    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  56.19 
 
 
704 aa  767    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  78.86 
 
 
690 aa  1108    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  55.8 
 
 
716 aa  748    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  64.31 
 
 
680 aa  893    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  62.33 
 
 
681 aa  811    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  72.38 
 
 
679 aa  978    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  54.52 
 
 
685 aa  703    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  100 
 
 
699 aa  1420    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  64.99 
 
 
680 aa  888    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  60.65 
 
 
683 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  79.41 
 
 
690 aa  1112    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  53.39 
 
 
689 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  79.56 
 
 
690 aa  1113    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  61.82 
 
 
681 aa  835    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  64.31 
 
 
680 aa  893    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  66.17 
 
 
680 aa  896    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  44.53 
 
 
642 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  45.2 
 
 
645 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  44.44 
 
 
652 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  41.44 
 
 
635 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  41.44 
 
 
635 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  41.49 
 
 
647 aa  490  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  42.07 
 
 
647 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  63.84 
 
 
846 aa  479  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  43.15 
 
 
676 aa  472  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  42.49 
 
 
644 aa  443  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  32.22 
 
 
650 aa  287  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  32.77 
 
 
600 aa  280  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  29.94 
 
 
573 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  32.59 
 
 
554 aa  173  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  28.74 
 
 
587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  29.1 
 
 
576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  29.1 
 
 
576 aa  165  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.02 
 
 
583 aa  165  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.02 
 
 
577 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.71 
 
 
577 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  26 
 
 
543 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  30.02 
 
 
562 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.6 
 
 
575 aa  154  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.23 
 
 
542 aa  153  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  28.02 
 
 
542 aa  150  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.34 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  28 
 
 
564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  27.94 
 
 
543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  28.67 
 
 
598 aa  147  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  28.24 
 
 
552 aa  146  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  28.53 
 
 
599 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.95 
 
 
566 aa  146  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  28.21 
 
 
565 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  28.21 
 
 
552 aa  144  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.43 
 
 
566 aa  144  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  30.94 
 
 
539 aa  143  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  27.31 
 
 
571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.59 
 
 
574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  28.8 
 
 
545 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.68 
 
 
559 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  28.16 
 
 
559 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  30 
 
 
548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  28.7 
 
 
556 aa  137  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  27.46 
 
 
591 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.27 
 
 
597 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  28.75 
 
 
556 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  28.73 
 
 
540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  28.97 
 
 
553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  28.96 
 
 
550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  29.82 
 
 
547 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  25.4 
 
 
545 aa  131  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  29.15 
 
 
541 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  26.93 
 
 
546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  27.59 
 
 
561 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.66 
 
 
535 aa  130  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.95 
 
 
591 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  27.12 
 
 
538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  26.91 
 
 
554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  27.59 
 
 
584 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  26.91 
 
 
554 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  29.45 
 
 
567 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  27.06 
 
 
561 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  29.49 
 
 
571 aa  127  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  29.23 
 
 
574 aa  127  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  28.84 
 
 
540 aa  127  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  27.06 
 
 
561 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  24.66 
 
 
658 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>