More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3188 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.67 
 
 
594 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  55.2 
 
 
595 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  56.35 
 
 
590 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.36 
 
 
594 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  55.87 
 
 
595 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  82 
 
 
589 aa  995    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.5 
 
 
594 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  56.35 
 
 
590 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55 
 
 
590 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.14 
 
 
601 aa  723    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  82.68 
 
 
589 aa  1008    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  56.68 
 
 
590 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.06 
 
 
601 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  81.66 
 
 
589 aa  993    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  100 
 
 
589 aa  1199    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.14 
 
 
601 aa  723    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.02 
 
 
593 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.46 
 
 
596 aa  685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  69.66 
 
 
590 aa  852    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  59.73 
 
 
591 aa  696    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  69.32 
 
 
590 aa  831    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.76 
 
 
589 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  58.01 
 
 
599 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  55.76 
 
 
589 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2910  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  58.68 
 
 
594 aa  684    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  65.38 
 
 
569 aa  788    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  60.71 
 
 
593 aa  707    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  56.9 
 
 
594 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.27 
 
 
593 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.49 
 
 
598 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  62.14 
 
 
601 aa  723    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.08 
 
 
591 aa  729    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.08 
 
 
600 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.33 
 
 
601 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.29 
 
 
591 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.46 
 
 
589 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  55.2 
 
 
595 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19370  putative asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  56.44 
 
 
589 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826487  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.37 
 
 
595 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.19 
 
 
590 aa  728    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.63 
 
 
598 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  57.77 
 
 
592 aa  705    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  54.79 
 
 
595 aa  631  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.42 
 
 
621 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  55.41 
 
 
588 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  53.7 
 
 
594 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.01 
 
 
593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.12 
 
 
610 aa  595  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  51.25 
 
 
602 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  51.09 
 
 
592 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.02 
 
 
628 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.98 
 
 
646 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.31 
 
 
592 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  34.14 
 
 
656 aa  299  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.97 
 
 
633 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4592  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.8 
 
 
645 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.65001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.95 
 
 
638 aa  297  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.47 
 
 
610 aa  296  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.54 
 
 
634 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.06 
 
 
635 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.52 
 
 
619 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.59 
 
 
631 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.92 
 
 
623 aa  292  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.85 
 
 
635 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.2 
 
 
629 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.86 
 
 
632 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.73 
 
 
634 aa  291  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.81 
 
 
655 aa  291  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.53 
 
 
629 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.01 
 
 
632 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.1 
 
 
633 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.06 
 
 
629 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  33.49 
 
 
643 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.55 
 
 
655 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.86 
 
 
656 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.78 
 
 
632 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.28 
 
 
633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.12 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.12 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  31.15 
 
 
632 aa  285  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  31.12 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  31.12 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.75 
 
 
656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.75 
 
 
656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.75 
 
 
656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.12 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.12 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.75 
 
 
656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.75 
 
 
656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.12 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.75 
 
 
656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.3 
 
 
656 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.8 
 
 
655 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.3 
 
 
656 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  30.83 
 
 
632 aa  283  7.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.55 
 
 
629 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.8 
 
 
655 aa  283  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  31.63 
 
 
637 aa  283  9e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2172  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.14 
 
 
665 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.71793  hitchhiker  0.0000206838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.64 
 
 
633 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>