22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1913 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0229  hypothetical protein  43.37 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5176  hypothetical protein  49.23 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  0.215484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4710  hypothetical protein  49.23 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0924938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  42.25 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5248  hypothetical protein  43.08 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.955188  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  34.57 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  38.03 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  32.89 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  34.88 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  28.95 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  36.36 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  28.95 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  29.11 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  29.49 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  32.89 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  32.47 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  31.17 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  32.43 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  31.58 
 
 
79 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>