More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4628 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
343 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  96.5 
 
 
343 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  96.79 
 
 
343 aa  653    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  85.63 
 
 
334 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  79.01 
 
 
343 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  66.97 
 
 
356 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.77 
 
 
345 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  64.26 
 
 
342 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  59.46 
 
 
339 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  60.36 
 
 
339 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  59.94 
 
 
339 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  58.04 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  61.65 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  56.68 
 
 
340 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  56.85 
 
 
343 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.86 
 
 
339 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  59.64 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  59.23 
 
 
339 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  55.99 
 
 
339 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  57.7 
 
 
339 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  35.74 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  36.58 
 
 
336 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  35.49 
 
 
303 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  35.88 
 
 
358 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.16 
 
 
319 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  32.23 
 
 
327 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  34.56 
 
 
327 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  32.32 
 
 
327 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.74 
 
 
327 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  30.55 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  31.71 
 
 
328 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  32.01 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.48 
 
 
305 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  32.91 
 
 
333 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  35.12 
 
 
324 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  33.33 
 
 
321 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  34.56 
 
 
370 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  35.28 
 
 
339 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  32.44 
 
 
319 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.19 
 
 
317 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.2 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.59 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.43 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  34.83 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.74 
 
 
378 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  30.9 
 
 
332 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  31.42 
 
 
337 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.04 
 
 
327 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  34.22 
 
 
342 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  33.71 
 
 
329 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  33.71 
 
 
329 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.77 
 
 
325 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  33.71 
 
 
329 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.62 
 
 
331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  31.53 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.02 
 
 
342 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  27.98 
 
 
318 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.69 
 
 
325 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  33.74 
 
 
347 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  29.66 
 
 
308 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  33 
 
 
320 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.27 
 
 
331 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.2 
 
 
322 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  32.01 
 
 
309 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  32.74 
 
 
318 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  32.44 
 
 
324 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.87 
 
 
353 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.19 
 
 
332 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  33.44 
 
 
321 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  31.29 
 
 
347 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  33.63 
 
 
353 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  30.27 
 
 
329 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  33.81 
 
 
369 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  32.62 
 
 
371 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.43 
 
 
332 aa  142  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.97 
 
 
329 aa  142  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  29.73 
 
 
323 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.03 
 
 
319 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  29.5 
 
 
331 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.78 
 
 
321 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  35.08 
 
 
369 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  30.59 
 
 
314 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  28.83 
 
 
312 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  33.65 
 
 
326 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.92 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.82 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.9 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  29.5 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.53 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  33.75 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  31.43 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  28.18 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  33.65 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  32.61 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  33.45 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.16 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  33.43 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  31.52 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  34.67 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.53 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>