More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4517 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  58.05 
 
 
691 aa  771    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  60.65 
 
 
683 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  66.96 
 
 
684 aa  894    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  67.21 
 
 
738 aa  909    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  56.07 
 
 
682 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  65.98 
 
 
680 aa  907    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  65.83 
 
 
686 aa  830    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  78.86 
 
 
699 aa  1088    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  52.2 
 
 
714 aa  685    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  61.8 
 
 
687 aa  809    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  73.41 
 
 
679 aa  990    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  67.26 
 
 
679 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  51.15 
 
 
802 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.29 
 
 
682 aa  836    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  100 
 
 
690 aa  1393    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  54.75 
 
 
678 aa  691    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  56.55 
 
 
704 aa  766    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  55.28 
 
 
716 aa  746    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  94.93 
 
 
690 aa  1325    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  65.98 
 
 
680 aa  907    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  62.04 
 
 
681 aa  814    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  93.91 
 
 
690 aa  1310    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  66.22 
 
 
680 aa  897    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  59.24 
 
 
692 aa  811    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  60 
 
 
686 aa  816    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  53.55 
 
 
685 aa  684    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  52.65 
 
 
689 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  75.18 
 
 
679 aa  976    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  65.78 
 
 
680 aa  897    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  63.38 
 
 
681 aa  841    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  65.98 
 
 
680 aa  907    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  67.99 
 
 
680 aa  922    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  68.88 
 
 
678 aa  914    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  46.33 
 
 
645 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  44.89 
 
 
642 aa  545  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  44.93 
 
 
652 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  42.81 
 
 
647 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  43.05 
 
 
647 aa  503  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  41.6 
 
 
635 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  41.75 
 
 
635 aa  505  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  43.72 
 
 
676 aa  492  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  66.85 
 
 
846 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  41.84 
 
 
644 aa  449  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  33.09 
 
 
650 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  31.72 
 
 
600 aa  273  9e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.14 
 
 
587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.6 
 
 
573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.27 
 
 
583 aa  175  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  31.26 
 
 
554 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.8 
 
 
576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.8 
 
 
576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.74 
 
 
566 aa  160  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.1 
 
 
577 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  24.66 
 
 
574 aa  156  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  27.26 
 
 
552 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.75 
 
 
577 aa  155  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.9 
 
 
566 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.51 
 
 
571 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.24 
 
 
542 aa  154  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.33 
 
 
575 aa  154  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  27.19 
 
 
543 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.61 
 
 
566 aa  153  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.07 
 
 
542 aa  151  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  27 
 
 
658 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  29.62 
 
 
598 aa  150  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.09 
 
 
597 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  27.48 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  25 
 
 
543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  29.73 
 
 
599 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  27.06 
 
 
559 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.08 
 
 
591 aa  147  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  28.55 
 
 
556 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  26.68 
 
 
565 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28 
 
 
539 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  28.14 
 
 
564 aa  140  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  28.05 
 
 
556 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  28.4 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  27.65 
 
 
561 aa  138  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.78 
 
 
626 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  28.51 
 
 
566 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.67 
 
 
552 aa  137  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  27.37 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  23.6 
 
 
700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  27.02 
 
 
554 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  27.37 
 
 
547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  27.85 
 
 
546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  27.36 
 
 
554 aa  134  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  28.6 
 
 
558 aa  134  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  27.58 
 
 
566 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.76 
 
 
686 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  27.58 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  27.58 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  26.83 
 
 
560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  30.26 
 
 
590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  27.58 
 
 
566 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  26.47 
 
 
611 aa  132  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  26.43 
 
 
548 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  27.58 
 
 
566 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  27.58 
 
 
609 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  27.14 
 
 
585 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>