30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3074 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  358  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  72.32 
 
 
177 aa  241  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  55.69 
 
 
167 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  44.79 
 
 
174 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  59.82 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  43.55 
 
 
150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  36 
 
 
185 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  42.96 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  41.96 
 
 
207 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  38.4 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  37.6 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  38.76 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  37.25 
 
 
237 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  39.29 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  39.29 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  37.82 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  39.29 
 
 
124 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  30.51 
 
 
258 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  33.64 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  29.63 
 
 
248 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  35.58 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  30.72 
 
 
273 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  26.71 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  26.37 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  40.38 
 
 
62 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  32.48 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  30.17 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  28.57 
 
 
261 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2626  hypothetical protein  33.67 
 
 
114 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  41.3 
 
 
58 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>