25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2552 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2552  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 429 aa  842    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263362  normal  0.0193136 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.49 
 
 		 904 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  29.86 
 
 		 904 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 		 1043 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  29.86 
 
 		 904 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  31.87 
 
 		 903 aa  156  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.18 
 
 		 882 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  31.86 
 
 		 943 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  31.88 
 
 		 962 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.41 
 
 		 906 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  32.24 
 
 		 1017 aa  133  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  28.79 
 
 		 834 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  27.18 
 
 		 828 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  28.53 
 
 		 833 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  29.08 
 
 		 831 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6102  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  28.88 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8076  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.08 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  26.11 
 
 		 887 aa  67  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  21.84 
 
 		 580 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  25.77 
 
 		 595 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  25.77 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  24.48 
 
 		 1321 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  25.09 
 
 		 610 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  25.09 
 
 		 610 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  25.09 
 
 		 610 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>