16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0868 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0932  hypothetical protein  73.65 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.766418  normal  0.967393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0893  hypothetical protein  73.65 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.935843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  52.55 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6383  hypothetical protein  44.21 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.947676  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  28.09 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  43.1 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  34.07 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  38.82 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  28.76 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  33.33 
 
 		 214 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  37.18 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  45.83 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  18.69 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  26.72 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>