19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0551 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  90.65 
 
 		 139 aa  257  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  90.65 
 
 		 139 aa  254  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  56.72 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.81 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1566  cupin 2 domain-containing protein  55.56 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.2 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  58.4 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4362  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.4 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2974  cupin 2 domain-containing protein  44.07 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  32.88 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  43.48 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  37.88 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4057  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3331  cupin domain-containing protein  36.84 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 148 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>