26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0164 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  79.46 
 
 
250 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  65.93 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  66.22 
 
 
251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  64.91 
 
 
251 aa  298  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  64.71 
 
 
251 aa  291  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  64.25 
 
 
251 aa  291  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1618  hypothetical protein  66.82 
 
 
222 aa  290  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  55.76 
 
 
246 aa  241  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  51.17 
 
 
218 aa  225  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  46.31 
 
 
209 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  46.41 
 
 
222 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5822  hypothetical protein  25.65 
 
 
251 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464349  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2127  hypothetical protein  27.01 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.728434  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1884  hypothetical protein  25.42 
 
 
254 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0872  hypothetical protein  24.87 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2102  hypothetical protein  25.58 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0811707  normal  0.0958552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  22.3 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  22.52 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  21.62 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  22.52 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  22.47 
 
 
242 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3677  hypothetical protein  22.47 
 
 
242 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  24.87 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  22.07 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  22.07 
 
 
242 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>