More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0603 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0603  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0442  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.059171  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.65 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5440  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.54 
 
 
72 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366792  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.4 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13280  rubredoxin rubA  68.09 
 
 
55 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.789329  normal  0.716019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4720  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
57 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4212  Alkane 1-monooxygenase  58 
 
 
470 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1351  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66 
 
 
53 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359999  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1334  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66 
 
 
53 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1743  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.78 
 
 
57 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.82 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64 
 
 
53 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5738  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.22 
 
 
54 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0122  alkane 1-monooxygenase  50 
 
 
481 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2749  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.57 
 
 
53 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  47.46 
 
 
591 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45 
 
 
455 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
444 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 
469 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
444 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
444 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.17 
 
 
476 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  53.66 
 
 
229 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
415 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
445 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.45 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
54 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  50 
 
 
57 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  50.98 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
56 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  48.72 
 
 
589 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  47.92 
 
 
56 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  46.15 
 
 
60 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
54 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
53 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  52.38 
 
 
56 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
52 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  51.11 
 
 
461 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.76 
 
 
52 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0248  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  53.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0899608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  49.02 
 
 
54 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  46.3 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  52.38 
 
 
53 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1804  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.18 
 
 
64 aa  52.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.839572  normal  0.255505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  50.98 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
54 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
221 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.17 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
56 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.38 
 
 
53 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
70 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.78 
 
 
52 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.07 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  47.92 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
70 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
56 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  47.92 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
70 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
54 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  50 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
70 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0750  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000427442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  50 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  48.89 
 
 
52 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
53 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3629  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
53 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  50 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.18 
 
 
52 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
54 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  50 
 
 
477 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.78 
 
 
195 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0111  rubredoxin  45.83 
 
 
57 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
56 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2083  rubredoxin  45.83 
 
 
57 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0735  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
52 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>