49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0959 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  58.04 
 
 
248 aa  248  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  55.47 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  53.52 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  47.48 
 
 
256 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  52.28 
 
 
255 aa  217  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  45.14 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  46.69 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  43.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  43.21 
 
 
250 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  42.39 
 
 
250 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  42.45 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  43.09 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  44.21 
 
 
250 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  44.49 
 
 
250 aa  182  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  40.73 
 
 
255 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  41.42 
 
 
251 aa  162  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  42.56 
 
 
258 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  43.1 
 
 
255 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  30.38 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  29.2 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  29.58 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  29.17 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  29.58 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  27.27 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  28.46 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  26.27 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  26.67 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  32.18 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  28.9 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  29.44 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  26.43 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  26.72 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  26.55 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  24.24 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  27.27 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  27.62 
 
 
245 aa  55.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  24.66 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  29.6 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  24 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  25.11 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  23.42 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  20.96 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  23.72 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  21.85 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  23.56 
 
 
235 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  28.87 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  21.56 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  23.83 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>