163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0679 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0679  methanogenesis marker 13 metalloprotein  100 
 
 
352 aa  705    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.682238  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1733  hypothetical protein  77.4 
 
 
354 aa  548  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1419  hypothetical protein  71.51 
 
 
357 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0746849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0670  hypothetical protein  70.82 
 
 
354 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0520  hypothetical protein  69.69 
 
 
353 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.268419  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0106  hypothetical protein  59.15 
 
 
369 aa  395  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0346  hypothetical protein  53.07 
 
 
370 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.949651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1037  hypothetical protein  53.2 
 
 
370 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00782668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1209  vanadium nitrogenase-associated related protein N  37.63 
 
 
366 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1413  vanadium nitrogenase-associated related protein N  35.11 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1425  vanadium nitrogenase-associated related protein N  39.13 
 
 
366 aa  232  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158785  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0483  vanadium nitrogenase-associated related protein N  37.9 
 
 
366 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0604601  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1313  vanadium nitrogenase-associated related protein N  34.76 
 
 
372 aa  228  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  29.63 
 
 
487 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  30.61 
 
 
509 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.29 
 
 
546 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.29 
 
 
546 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  28.06 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.63 
 
 
544 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.29 
 
 
544 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  33.61 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  29.03 
 
 
505 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.68 
 
 
456 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.61 
 
 
467 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.17 
 
 
544 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.85 
 
 
551 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  31.53 
 
 
542 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.66 
 
 
546 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.21 
 
 
546 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.09 
 
 
545 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  36.78 
 
 
448 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.55 
 
 
542 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.87 
 
 
905 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  29 
 
 
516 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  25.4 
 
 
509 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25.58 
 
 
915 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0235  oxidoreductase/nitrogenase component 1  35.85 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  28.36 
 
 
512 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.55 
 
 
541 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1943  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  31.93 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.2 
 
 
539 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  28.78 
 
 
515 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  31.53 
 
 
466 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.2 
 
 
919 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1350  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.92 
 
 
455 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1788  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.84 
 
 
470 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  32 
 
 
475 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  36.84 
 
 
470 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.615494  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  31.4 
 
 
454 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1076  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  31.87 
 
 
488 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.57688  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29 
 
 
936 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.47 
 
 
463 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29.07 
 
 
917 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.42 
 
 
540 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.35 
 
 
539 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.71 
 
 
918 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1553  nitrogenase, subunit D  28.41 
 
 
530 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  29.81 
 
 
475 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2081  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  32.65 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  24.26 
 
 
461 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  32.53 
 
 
919 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  29.41 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4796  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.21 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.933705  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0168  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.78 
 
 
533 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488812  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  28.69 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.47 
 
 
480 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0794  nitrogenase  27.37 
 
 
511 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1052  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  32.04 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.89 
 
 
458 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  32.95 
 
 
511 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  26.47 
 
 
587 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.61 
 
 
461 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.93 
 
 
510 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02770  nitrogenase vanadium iron cofactor biosynthesis protein vnfE  35.92 
 
 
469 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6878  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  34.23 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.785272  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  26.32 
 
 
458 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  23.75 
 
 
469 aa  47  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.11 
 
 
917 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  31.25 
 
 
459 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0164  hypothetical protein  30.61 
 
 
339 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  30.77 
 
 
462 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  29.55 
 
 
518 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26 
 
 
487 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5098  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  33.73 
 
 
487 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.4 
 
 
918 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0972  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  32.53 
 
 
488 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  32.14 
 
 
466 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  30.77 
 
 
462 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.11 
 
 
489 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  28.37 
 
 
465 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.14 
 
 
461 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2117  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.9 
 
 
467 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0140649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.4 
 
 
918 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  30.77 
 
 
462 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  30.77 
 
 
462 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.74 
 
 
506 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  26.09 
 
 
458 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  26.09 
 
 
458 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  29.87 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>