More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8036 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8036  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
343 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4628  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  79.01 
 
 
343 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4146  ATPase  79.01 
 
 
343 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.661035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4514  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.72 
 
 
343 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0165185  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4206  ATPase  79.64 
 
 
334 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0979498  normal  0.146626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.27 
 
 
345 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1911  ATPase  66.97 
 
 
356 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1525  moxR protein, putative  62.76 
 
 
342 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0519563  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  62.5 
 
 
339 aa  414  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2040  ATPase  59.16 
 
 
339 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  58.43 
 
 
338 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1896  MoxR protein, putative  58.33 
 
 
340 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155762 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  59.94 
 
 
339 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0783  moxR protein  58.63 
 
 
339 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587731  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4033  ATPase  57.27 
 
 
339 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  58.01 
 
 
339 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  55.79 
 
 
343 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2421  putative MxaR-like protein  56.08 
 
 
339 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868605  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3278  MoxR protein, putative  57.06 
 
 
339 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3047  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.38 
 
 
339 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  37.09 
 
 
336 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.41 
 
 
332 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  36.39 
 
 
325 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  35.9 
 
 
327 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.48 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  35.29 
 
 
358 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.05 
 
 
319 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  33.43 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  32.23 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.95 
 
 
354 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.81 
 
 
331 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  35.59 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  35.59 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  36.14 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  31.64 
 
 
327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  35.59 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.02 
 
 
354 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.97 
 
 
331 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.06 
 
 
325 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  33.23 
 
 
319 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  31.4 
 
 
327 aa  146  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  32.48 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  34.66 
 
 
370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  34.86 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.86 
 
 
354 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.33 
 
 
317 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  28.17 
 
 
318 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  35.42 
 
 
342 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  30.9 
 
 
332 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  33.98 
 
 
319 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  34.9 
 
 
353 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.12 
 
 
342 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.82 
 
 
356 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.03 
 
 
350 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.05 
 
 
332 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.28 
 
 
327 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  35.33 
 
 
371 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  32.54 
 
 
319 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.53 
 
 
327 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.36 
 
 
378 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.84 
 
 
387 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  31.07 
 
 
332 aa  142  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  34.64 
 
 
320 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  31.09 
 
 
359 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  34.29 
 
 
369 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  34.64 
 
 
320 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  34.64 
 
 
320 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  33.73 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  28.88 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.44 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.53 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  34.69 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  32.72 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  34.8 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  33.55 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  34.32 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  34.86 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.09 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.41 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  32.82 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  33.22 
 
 
319 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  37.12 
 
 
369 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.48 
 
 
336 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  30.15 
 
 
325 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  33.22 
 
 
319 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.05 
 
 
337 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.96 
 
 
305 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  33.22 
 
 
319 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.05 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  33.64 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.96 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.19 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  36.27 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  33.55 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2146  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.94 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  33.22 
 
 
319 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.87 
 
 
322 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  33.84 
 
 
334 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  33.33 
 
 
324 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>