18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5589 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5589  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  991    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1668  hypothetical protein  35.26 
 
 		 481 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3797  hypothetical protein  37.63 
 
 		 471 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  32.81 
 
 		 975 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3947  hypothetical protein  30.55 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.917121  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0556  Carbohydrate-binding CenC domain protein  36.04 
 
 		 857 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3349  hypothetical protein  32.04 
 
 		 559 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4459  hypothetical protein  24.61 
 
 		 778 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0816  hypothetical protein  27.9 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  27.16 
 
 		 907 aa  48.5  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  29.93 
 
 		 882 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  26.52 
 
 		 874 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  28.47 
 
 		 911 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  28.47 
 
 		 911 aa  47  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  28.47 
 
 		 911 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  29.25 
 
 		 880 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0160  hypothetical protein  23.37 
 
 		 600 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  28.57 
 
 		 883 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>