19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1127 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1127  YCII-related  100 
 
 		 109 aa  218  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2165  YCII-related  75.76 
 
 		 109 aa  157  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.0780473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2205  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.872222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3969  YCII-related  45.26 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3680  YCII-related protein  45.36 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2366  YCII-related protein  37.5 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0157  YCII-related  47.52 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0081  YCII-related  43.9 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0923  YCII-related  46.46 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4066  hypothetical protein  36.46 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0655  YCII-related  40.74 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.622493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0675  YCII-related  40.51 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0662  YCII-related  40.51 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3217  hypothetical protein  32.63 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4943  hypothetical protein  32.63 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1943  hypothetical protein  39.73 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0106441  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2076  YCII domain-containing protein  40.91 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000637229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1725  hypothetical protein  42.37 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.084277  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  36.84 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>