18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0504 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  29.94 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  31.55 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  33.97 
 
 		 361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  32.34 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  31.87 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  29.91 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  31.75 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  31.6 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  31.54 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  26.17 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  26.56 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 		 523 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  34.38 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  31.25 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3716  hypothetical protein  30.34 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  24.49 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2655  hypothetical protein  30.31 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>