27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4367 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  51.43 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  53.85 
 
 		 662 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  37.65 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  36.47 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  45.9 
 
 		 772 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  34.12 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  32.94 
 
 		 128 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  35.71 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  37.7 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  37.7 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  32.94 
 
 		 116 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  49.15 
 
 		 671 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  37.5 
 
 		 136 aa  52.4  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  42.42 
 
 		 715 aa  52  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  28.44 
 
 		 120 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  23.08 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  23.02 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  40.32 
 
 		 738 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.72 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  40.32 
 
 		 738 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.27 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  38.96 
 
 		 688 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.84 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  26.42 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>