28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3972 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  66.06 
 
 
116 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  47.32 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  46.43 
 
 
128 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  48.28 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  48.21 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0471  hypothetical protein  58.43 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000925994  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  47.41 
 
 
124 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  47.32 
 
 
128 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  45.13 
 
 
120 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  45.22 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  41.33 
 
 
715 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  42.86 
 
 
662 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  35.71 
 
 
216 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  51.92 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  45 
 
 
671 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2615  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2603  putative cytoplasmic protein  33.33 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.715844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2562  putative cytoplasmic protein  32.5 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2726  hypothetical protein  32.5 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316487  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2515  putative cytoplasmic protein  32.5 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  37.7 
 
 
772 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  44.44 
 
 
718 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  38.36 
 
 
738 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  43.64 
 
 
738 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  36.92 
 
 
669 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>