13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2279 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2279  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  24.15 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  23.45 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  22.27 
 
 
321 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  26.02 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1386  hypothetical protein  19.8 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481279  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2510  acetolactate synthase small subunit  23.63 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180225  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  24.36 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3582  hypothetical protein  25.56 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  21.48 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  25.74 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  24.29 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  22.96 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>