More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1458 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  100 
 
 
416 aa  858    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  56.03 
 
 
421 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  31.74 
 
 
403 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  31.19 
 
 
549 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  28.76 
 
 
546 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  31.27 
 
 
534 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  28.49 
 
 
537 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  29.31 
 
 
533 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  28.97 
 
 
533 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  27.88 
 
 
551 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  26.69 
 
 
560 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  29.47 
 
 
572 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  27.06 
 
 
535 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  27.87 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  27.87 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  27.87 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 
549 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  31.65 
 
 
449 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  27.19 
 
 
547 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  29.57 
 
 
538 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  25.07 
 
 
535 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  25.23 
 
 
546 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  27.54 
 
 
540 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  24.25 
 
 
540 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  25.61 
 
 
577 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  29.81 
 
 
553 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  28.57 
 
 
587 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  28.91 
 
 
555 aa  96.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  31.93 
 
 
148 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  29.32 
 
 
188 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
129 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0315  putative response regulator  28.86 
 
 
576 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
129 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 
129 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 
129 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
131 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
131 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
131 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
131 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
131 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
127 aa  80.5  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  22.33 
 
 
561 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  32.2 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
131 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.05 
 
 
130 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 
131 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  32.23 
 
 
131 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
127 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
129 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
131 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  33.05 
 
 
127 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  32.48 
 
 
129 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  32.48 
 
 
129 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  32.48 
 
 
129 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  33.87 
 
 
132 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  32.48 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  32.48 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  32.48 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  32.48 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  32.48 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
132 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  27.97 
 
 
139 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  30.77 
 
 
129 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
129 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  30.51 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  30.51 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  30.51 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 
129 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  31.25 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 
129 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 
129 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  30.51 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  30.51 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  30.51 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 
129 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 
129 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  30.51 
 
 
131 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  30.77 
 
 
129 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
139 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  31.09 
 
 
131 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  29.66 
 
 
131 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
123 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
133 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  32.2 
 
 
122 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  30.51 
 
 
127 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
127 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
127 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
133 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  30.23 
 
 
135 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
127 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
127 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
127 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
127 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
123 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
127 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>