16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0843 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  100 
 
 
440 aa  888    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  32.75 
 
 
446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  22.95 
 
 
439 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  26.88 
 
 
424 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  24.65 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  37.84 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0799  O-antigen polymerase  26.95 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00494175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  23.94 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1918  O-antigen polymerase  26.52 
 
 
420 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5389  O-antigen polymerase (wzy)  26.11 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  22.51 
 
 
738 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1436  O-antigen polymerase  26.1 
 
 
404 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  22.6 
 
 
426 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  25.91 
 
 
459 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  26.92 
 
 
429 aa  43.5  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  18.78 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>