299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0002 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0017  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4339  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0016  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0046  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0015  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0029  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000441768  normal  0.0859577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0011    93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0001  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.272552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0002  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0019  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0012  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0019  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.189321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0048  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA3  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0007  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0064  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.805533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0032  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0044  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331518  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6015  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6008  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.458315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0049  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0045  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0014  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.580851  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0014  tRNA-Ala  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0044  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000237327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0080  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00204855  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0114  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000837994  normal  0.210709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0035  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000225526  normal  0.205533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0047  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.119582  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0085  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000688408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0103  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0071  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0040  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000974841  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000523195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0011  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0065  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.485715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0048  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00170622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0023  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0036  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000936293  normal  0.188106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0033  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000292455  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0022  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0097  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000376718  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t41  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t62  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.132362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0011  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000293397  hitchhiker  0.000919348 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0091  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000036342  hitchhiker  0.00439232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0068  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240621  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0062  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0019  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6047  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0023  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000263771  hitchhiker  0.000576138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0060  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273656  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0015  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00408326  hitchhiker  0.00315011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0008  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000983847  hitchhiker  0.000163043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0078  tRNA-Ala  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000280494  normal  0.145068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>