31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1467 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2494  zinc-dependent metallopeptidase  51.45 
 
 
619 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2259  Peptidyl-dipeptidase A  51.06 
 
 
621 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2544  peptidyl-dipeptidase A  52.39 
 
 
612 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2170  peptidyl-dipeptidase A  50.74 
 
 
621 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.200935  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2340  peptidyl-dipeptidase A  53.54 
 
 
612 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2057  peptidyl-dipeptidase A  51.53 
 
 
611 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000365175  normal  0.118156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2125  peptidyl-dipeptidase A  50.25 
 
 
621 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2667  peptidyl-dipeptidase A  57.62 
 
 
620 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2053  peptidyl-dipeptidase A  50.88 
 
 
634 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.10811  normal  0.434811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2246  peptidyl-dipeptidase A  50.9 
 
 
621 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4532  hypothetical protein  50.9 
 
 
621 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1817  peptidyl-dipeptidase A  52.76 
 
 
618 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0907882  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1467  peptidyl-dipeptidase A  100 
 
 
617 aa  1275    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000834106  normal  0.0509695 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2117  peptidyl-dipeptidase A  52.86 
 
 
612 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000679972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0456  peptidyl-dipeptidase A  53.45 
 
 
612 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2051  peptidyl-dipeptidase A  53.9 
 
 
620 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115163  normal  0.257719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1924  peptidyl-dipeptidase A  53.9 
 
 
620 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000467858  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1887  peptidyl-dipeptidase A  51.48 
 
 
613 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2156  peptidase M2, peptidyl-dipeptidase A  53.73 
 
 
619 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.793528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02324  zinc-dependent metallopeptidase  51.03 
 
 
606 aa  632  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000183943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1585  zinc metallopeptidase family protein  48.78 
 
 
619 aa  633  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0184  peptidyl-dipeptidase A  52.09 
 
 
609 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4468  peptidyl-dipeptidase A  47.53 
 
 
623 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19029  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6422  Peptidyl-dipeptidase A  47.19 
 
 
621 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1785  peptidyl-dipeptidase A  45.66 
 
 
622 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2024  peptidyl-dipeptidase A  47.85 
 
 
614 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1854  Peptidyl-dipeptidase A  47.33 
 
 
614 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1939  Peptidyl-dipeptidase A  47.33 
 
 
614 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2996  Peptidyl-dipeptidase A  39.25 
 
 
654 aa  485  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000459005  normal  0.0414122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04473  dipeptidyl carboxypeptidase I  37.99 
 
 
672 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.951227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  24.95 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>