17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1569 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1569  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  100 
 
 		 122 aa  244  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0257686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1960  RNA polymerase Rpb4  56.03 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0548  RNA polymerase Rpb4  54.31 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1873  RNA polymerase Rpb4  51.72 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.339371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3027  RNA polymerase Rpb4  45.69 
 
 		 117 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3232  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  47.41 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033159  normal  0.0783497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0904  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  48.28 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000866126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0994  RNA polymerase Rpb4  41.67 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242565  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1097  RNA polymerase Rpb4  33.05 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.385582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2389  RNA polymerase Rpb4  31.36 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0623  RNA polymerase Rpb4  34.45 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.570875  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2278  RNA polymerase Rpb4  28.81 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.452982  normal  0.153083 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2673  RNA polymerase Rpb4  30.25 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.406988 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0764  RNA polymerase Rpb4  29.89 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0062  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  35.06 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.20245  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1104  RNA polymerase Rpb4  28.81 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1584  DNA-directed RNA polymerase, subunit F  26.27 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>