166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0520 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0520  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  716    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.268419  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1733  hypothetical protein  72.8 
 
 
354 aa  527  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1419  hypothetical protein  68.75 
 
 
357 aa  503  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0746849 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0679  methanogenesis marker 13 metalloprotein  69.69 
 
 
352 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.682238  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0670  hypothetical protein  66.01 
 
 
354 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0106  hypothetical protein  54.75 
 
 
369 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1037  hypothetical protein  53.2 
 
 
370 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00782668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0346  hypothetical protein  52.51 
 
 
370 aa  361  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.949651 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1425  vanadium nitrogenase-associated related protein N  42.01 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158785  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1209  vanadium nitrogenase-associated related protein N  40.6 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1413  vanadium nitrogenase-associated related protein N  38.87 
 
 
366 aa  239  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0483  vanadium nitrogenase-associated related protein N  41.19 
 
 
366 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0604601  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1313  vanadium nitrogenase-associated related protein N  37.9 
 
 
372 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  34.23 
 
 
505 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1943  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  32.56 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  35.35 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  28.46 
 
 
509 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.17 
 
 
544 aa  56.6  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.74 
 
 
546 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  30.08 
 
 
509 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.74 
 
 
546 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  34.45 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.74 
 
 
544 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  37.21 
 
 
542 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  32.22 
 
 
487 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  30.43 
 
 
511 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.63 
 
 
546 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.97 
 
 
544 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6878  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  30.22 
 
 
457 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.785272  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  31.91 
 
 
540 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0235  oxidoreductase/nitrogenase component 1  35.79 
 
 
387 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1350  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  32.38 
 
 
455 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  30.58 
 
 
512 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  29.29 
 
 
516 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  32.56 
 
 
542 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  29.9 
 
 
519 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.12 
 
 
546 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.4 
 
 
523 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1427  nitrogenase  30.26 
 
 
469 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  31.18 
 
 
539 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  31.11 
 
 
480 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  30.5 
 
 
918 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  29.21 
 
 
501 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  32.99 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.615494  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  30.93 
 
 
905 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4796  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.77 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.933705  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2117  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.37 
 
 
467 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0140649 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  23.49 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1788  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  32.99 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.14 
 
 
522 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  29.76 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  27.08 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  31.52 
 
 
551 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  22.86 
 
 
458 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  30.1 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  31.03 
 
 
459 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  29.79 
 
 
918 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  26.17 
 
 
475 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  22.82 
 
 
458 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  33.73 
 
 
475 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.21 
 
 
513 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  27.4 
 
 
462 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  29 
 
 
467 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1028  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.52 
 
 
504 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.29 
 
 
518 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  22.82 
 
 
458 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  28.1 
 
 
519 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  28.09 
 
 
587 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.95 
 
 
919 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4485  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  29.23 
 
 
456 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.1 
 
 
519 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  26.71 
 
 
462 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  27.84 
 
 
519 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  31.25 
 
 
475 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  26.71 
 
 
462 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.91 
 
 
936 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.84 
 
 
519 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.96 
 
 
541 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  26.71 
 
 
462 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  28.21 
 
 
446 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.87 
 
 
519 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.34 
 
 
511 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  28.09 
 
 
425 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.86 
 
 
487 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.36 
 
 
917 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25.18 
 
 
915 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.27 
 
 
487 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.86 
 
 
523 aa  46.2  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.53 
 
 
510 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  31.87 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0476  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  28.41 
 
 
629 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.94 
 
 
518 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.27 
 
 
489 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0163  hypothetical protein  30.53 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.14 
 
 
511 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.57 
 
 
539 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.55 
 
 
519 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  27.27 
 
 
515 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  26.56 
 
 
511 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.55 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>