46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2196 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  71.92 
 
 		 532 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  100 
 
 		 541 aa  1050    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  72.11 
 
 		 532 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  76.99 
 
 		 540 aa  662    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  71.92 
 
 		 532 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  41.37 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  41.15 
 
 		 532 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  38.74 
 
 		 552 aa  260  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  38.62 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  37.36 
 
 		 550 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  34.97 
 
 		 565 aa  227  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  28.89 
 
 		 534 aa  223  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  36.22 
 
 		 555 aa  217  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.89 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  38.15 
 
 		 539 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  37.15 
 
 		 540 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  34.67 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  30.02 
 
 		 555 aa  200  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.23 
 
 		 652 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  33.09 
 
 		 561 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  33.39 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  29 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  37.45 
 
 		 533 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.91 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  31.17 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  34.92 
 
 		 523 aa  170  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  31.6 
 
 		 529 aa  170  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30.41 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30.51 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  32.33 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  32.53 
 
 		 548 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  32.89 
 
 		 529 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  31.29 
 
 		 551 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  31.93 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  30.25 
 
 		 530 aa  124  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  33.06 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  24.57 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  31.58 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  28.76 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  26.08 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  30.16 
 
 		 544 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  24.27 
 
 		 536 aa  98.2  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.46 
 
 		 542 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.61 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.61 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.08 
 
 		 546 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>