35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0372 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  63.11 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  62.3 
 
 
121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  59.65 
 
 
114 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  59.65 
 
 
114 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  34.15 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2480  hypothetical protein  63.46 
 
 
58 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  30.08 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  29.37 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  29.75 
 
 
122 aa  59.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  29.6 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  31.93 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  30.77 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  30.77 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  27.27 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  29.81 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  29.81 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  24.19 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  27.27 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 
285 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  25.42 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  26.27 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  23.97 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  26.45 
 
 
127 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  25.62 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  25.62 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  25.42 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  25.42 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  25.62 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  26.83 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3783  hypothetical protein  22.03 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  28.43 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  25.42 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  30.39 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>