63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0330 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  610  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  83.22 
 
 
302 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  73.51 
 
 
303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  73.51 
 
 
303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  73.51 
 
 
303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  67.23 
 
 
306 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  59.02 
 
 
284 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  50.38 
 
 
272 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  50.18 
 
 
271 aa  238  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  46.62 
 
 
285 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  46.06 
 
 
342 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  44.91 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  42.96 
 
 
315 aa  215  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  44.44 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  44.94 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  44.94 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  44.94 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  38.32 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  39.51 
 
 
282 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  39 
 
 
257 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  36.84 
 
 
268 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 
292 aa  125  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  30.8 
 
 
281 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  34.13 
 
 
290 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  30.89 
 
 
285 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  27.49 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  26.46 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  30.16 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  28.74 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  28.44 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  24.7 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  27.31 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  28.29 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  22.92 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  26.67 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  23.05 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  23.05 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  23 
 
 
312 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  25.9 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  26.24 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  27.67 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  22.82 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  22.86 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  21.83 
 
 
351 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  25.44 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3252  hypothetical protein  26.4 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  23.2 
 
 
339 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  27.72 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  25.7 
 
 
364 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10481  conserved hypothetical protein  22.47 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00162641  normal  0.337442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  23.75 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  26.04 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2991  hypothetical protein  21.79 
 
 
351 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0321859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2976  hypothetical protein  21.79 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3020  hypothetical protein  21.79 
 
 
351 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3322  hypothetical protein  23.23 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  25 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  27.48 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03292  hypothetical protein  38.03 
 
 
111 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00451567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3536  hypothetical protein  21.16 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0180076  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  25.61 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>