28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1310 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  100 
 
 
102 aa  208  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3738  hypothetical protein  59.41 
 
 
105 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3533  IS3 family transposase orfA  59.41 
 
 
105 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0615  IS3 family transposase orfA  59.41 
 
 
105 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0753  hypothetical protein  59.41 
 
 
105 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2024  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0878347  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2226  transposase  64.2 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000869516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0892  transposase  64.2 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  61.73 
 
 
88 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1594  transposase  61.73 
 
 
83 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128024  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00296  transposase  61.29 
 
 
74 aa  84  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00171354  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3187  IS3 family transposase orfA  55.17 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3185  hypothetical protein  64.58 
 
 
50 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.654544 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  34.88 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  34.88 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  34.88 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  34.88 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 
374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2796  transposase  58.82 
 
 
43 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  31.76 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1507  hypothetical protein  33.93 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362913  normal  0.80475 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4285  hypothetical protein  52.78 
 
 
44 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635974  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4097  hypothetical protein  39.22 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  29.41 
 
 
97 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1400  hypothetical protein  36.54 
 
 
92 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>