25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1228 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  50.94 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  55.56 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  43.86 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  50.91 
 
 
64 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  46.15 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  46.15 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  46.15 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  54.76 
 
 
59 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  41.07 
 
 
58 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  48.08 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  44.23 
 
 
64 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  45.83 
 
 
64 aa  50.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  53.85 
 
 
58 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  55.56 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  40.38 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  42 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  51.16 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  52.83 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  34.69 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  38.16 
 
 
81 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  37.84 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  35.71 
 
 
69 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>