More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4625 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  80.89 
 
 
1174 aa  1745    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  41.54 
 
 
2684 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1153 aa  2246    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  39.76 
 
 
2710 aa  743    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  40.61 
 
 
2679 aa  753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  96.18 
 
 
1153 aa  2088    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  39.19 
 
 
3335 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  39.94 
 
 
6403 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  33.55 
 
 
3235 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  34.75 
 
 
1093 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  36.16 
 
 
2682 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  35.16 
 
 
2581 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  38.6 
 
 
4747 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.31 
 
 
6889 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  37.76 
 
 
1668 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.01 
 
 
5953 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  39.17 
 
 
4991 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  34.12 
 
 
2063 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  38.38 
 
 
3470 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.64 
 
 
6676 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  38.53 
 
 
1129 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  37.31 
 
 
3432 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35 
 
 
2033 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  32.35 
 
 
1786 aa  555  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.11 
 
 
5149 aa  552  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  37.3 
 
 
4136 aa  549  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  34.11 
 
 
1740 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.03 
 
 
2791 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.14 
 
 
1839 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.25 
 
 
4531 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.11 
 
 
3308 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  36.77 
 
 
5596 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.39 
 
 
8646 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  38.6 
 
 
3629 aa  535  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.21 
 
 
2867 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  32.98 
 
 
1142 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  34.48 
 
 
4502 aa  534  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.46 
 
 
2370 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  30.92 
 
 
3086 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  31.13 
 
 
3086 aa  532  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.69 
 
 
1870 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.84 
 
 
1556 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  35.7 
 
 
4478 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  35.29 
 
 
2845 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  33.93 
 
 
1578 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.66 
 
 
1870 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  36.96 
 
 
3404 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  36.92 
 
 
4383 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  37.62 
 
 
3328 aa  526  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  37.5 
 
 
6072 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.46 
 
 
1556 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  37.62 
 
 
3352 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  37.52 
 
 
6006 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  37.5 
 
 
6081 aa  526  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.3 
 
 
3498 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  33.94 
 
 
1753 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 
3176 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.43 
 
 
1550 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  34.68 
 
 
1553 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  31.27 
 
 
3291 aa  513  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  33.45 
 
 
2571 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  33.45 
 
 
2571 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0353  amino acid adenylation domain-containing protein  36.83 
 
 
1054 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224507  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  34.7 
 
 
5213 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  35.65 
 
 
3432 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  34.59 
 
 
3348 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.7 
 
 
7310 aa  509  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  38.39 
 
 
1083 aa  506  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  38.16 
 
 
1769 aa  506  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  34.82 
 
 
2151 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  35.48 
 
 
2154 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.89 
 
 
5926 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  36.52 
 
 
1199 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  37.22 
 
 
2106 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  34.41 
 
 
3291 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1678  amino acid adenylation domain protein  33.07 
 
 
1393 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31 
 
 
2156 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  36.47 
 
 
2137 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  31.17 
 
 
2752 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.82 
 
 
5328 aa  499  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.3 
 
 
2156 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.07 
 
 
3002 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.2 
 
 
3639 aa  495  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.72 
 
 
4336 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  34.82 
 
 
4882 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.7 
 
 
3925 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  31.15 
 
 
2006 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  35.87 
 
 
1776 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  38.47 
 
 
1726 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  34.89 
 
 
6661 aa  489  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.01 
 
 
3021 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  35.82 
 
 
2125 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  32.76 
 
 
2664 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.89 
 
 
13537 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  32.76 
 
 
2395 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.21 
 
 
8914 aa  485  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  36.93 
 
 
2350 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  32.76 
 
 
2395 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  36.1 
 
 
4483 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 
4968 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>