More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4035 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  64.95 
 
 		 680 aa  889    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  67.31 
 
 		 679 aa  916    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  69.62 
 
 		 678 aa  931    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  66.22 
 
 		 680 aa  897    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  61.96 
 
 		 687 aa  806    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  98.7 
 
 		 690 aa  1375    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  56.66 
 
 		 682 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  52.14 
 
 		 714 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  74.15 
 
 		 679 aa  969    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  56.41 
 
 		 704 aa  775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  55.19 
 
 		 678 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  60.44 
 
 		 686 aa  815    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  54.73 
 
 		 685 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  65.59 
 
 		 680 aa  902    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  79.56 
 
 		 699 aa  1093    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  59.53 
 
 		 692 aa  809    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  67.06 
 
 		 738 aa  906    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  51.97 
 
 		 802 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  66.72 
 
 		 684 aa  899    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  93.91 
 
 		 690 aa  1310    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  65.15 
 
 		 686 aa  824    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.47 
 
 		 682 aa  825    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  55.2 
 
 		 716 aa  748    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  73.71 
 
 		 679 aa  996    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  100 
 
 		 690 aa  1397    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  65.59 
 
 		 680 aa  902    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  62 
 
 		 681 aa  816    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  57.9 
 
 		 691 aa  763    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  53.46 
 
 		 689 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  59.77 
 
 		 683 aa  784    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  62.26 
 
 		 681 aa  831    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  65.59 
 
 		 680 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  67.16 
 
 		 680 aa  913    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  45.88 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  45.58 
 
 		 652 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  44.76 
 
 		 642 aa  538  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  42.28 
 
 		 647 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  42.36 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  43.5 
 
 		 647 aa  510  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  42.36 
 
 		 635 aa  512  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  66.85 
 
 		 846 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  44.52 
 
 		 676 aa  493  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  42.07 
 
 		 644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  32.79 
 
 		 650 aa  313  9e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  31.68 
 
 		 600 aa  278  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  29.43 
 
 		 587 aa  187  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.76 
 
 		 573 aa  184  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.22 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  31.46 
 
 		 554 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.42 
 
 		 576 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.22 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.65 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.17 
 
 		 577 aa  161  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.12 
 
 		 542 aa  160  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  28.92 
 
 		 542 aa  157  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  26.28 
 
 		 574 aa  156  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.88 
 
 		 566 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.11 
 
 		 575 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.78 
 
 		 591 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.9 
 
 		 566 aa  153  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  26.32 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.41 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  30.77 
 
 		 599 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.77 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.99 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  28.6 
 
 		 598 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  27.33 
 
 		 559 aa  150  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  26.88 
 
 		 658 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  28.77 
 
 		 556 aa  147  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.64 
 
 		 543 aa  146  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.76 
 
 		 686 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  29.27 
 
 		 545 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  28.57 
 
 		 556 aa  144  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.62 
 
 		 564 aa  142  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.01 
 
 		 539 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  27.13 
 
 		 538 aa  141  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  25.68 
 
 		 562 aa  140  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  27.3 
 
 		 611 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.07 
 
 		 552 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  25.13 
 
 		 700 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  25.64 
 
 		 565 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  27.81 
 
 		 546 aa  137  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  28.7 
 
 		 550 aa  137  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.16 
 
 		 597 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  27.92 
 
 		 566 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.81 
 
 		 559 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.35 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  26.84 
 
 		 541 aa  134  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  27 
 
 		 545 aa  134  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  25.24 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  25.24 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  27.98 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  26.55 
 
 		 560 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.88 
 
 		 626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  26.96 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  26.74 
 
 		 591 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  27.76 
 
 		 558 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  28.29 
 
 		 546 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  26.86 
 
 		 574 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  27.08 
 
 		 561 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>