164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2728 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  95.01 
 
 
385 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2728  O-methyltransferase family protein  100 
 
 
381 aa  734    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  77.69 
 
 
381 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  68 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3695  O-methyltransferase family protein  71.78 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  54.2 
 
 
381 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  49.86 
 
 
373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  53.89 
 
 
396 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  50.54 
 
 
380 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  51.88 
 
 
381 aa  333  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  49.46 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  51.51 
 
 
381 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  50.93 
 
 
377 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  43.28 
 
 
378 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  45.1 
 
 
379 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  44.54 
 
 
379 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  43.05 
 
 
376 aa  255  9e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  44.57 
 
 
379 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  30.36 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  27.67 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  29.82 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.74 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  28.78 
 
 
375 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  25.6 
 
 
331 aa  92.8  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.48 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.48 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.41 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.41 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.48 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.41 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  34.59 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  28.96 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  28.97 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  22.65 
 
 
339 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.71 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  35.62 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.13 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.21 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.13 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  28.8 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  29.27 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  30.61 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  29.53 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  23.68 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  23.46 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  30 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  27.27 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  29.22 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.35 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  27.38 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  26.79 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  28.21 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  31.89 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  26.79 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  30.4 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  30.53 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  27.05 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  25.55 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  24 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  26.05 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  23.82 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  27.16 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  27.86 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  29.94 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  29.94 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  29.94 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  29.94 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  29.94 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  29.94 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  25.15 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  24.15 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3051  O-methyltransferase family 2  29.25 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  26.35 
 
 
364 aa  67  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  24.85 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  27.81 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  25.7 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  28.06 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  28.57 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.37 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  31.74 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  24.42 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  25.95 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  26.54 
 
 
353 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.45 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  27.89 
 
 
336 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  33.17 
 
 
345 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1927  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.38 
 
 
343 aa  63.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.754339  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  28.98 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  36.13 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  25 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.58 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  31.95 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  28.25 
 
 
330 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  23.87 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  25.45 
 
 
338 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  35.46 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  29.87 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  27.96 
 
 
327 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>