16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0932 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.766418  normal  0.967393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0893  hypothetical protein  97.47 
 
 		 277 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.935843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  80.17 
 
 		 277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  54.25 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6383  hypothetical protein  42.55 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.947676  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  22.27 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  25.55 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  27.52 
 
 		 208 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  39.66 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  46.88 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  26.11 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  23.53 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  33.82 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  32.05 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  24.87 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  31.17 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>